vestnovsuВестник Новгородского государственного университетаVestnik of Novgorod State University2076-8052Новгородский государственный университет имени Ярослава Мудрого10.34680/2076-8052.2024.3(137).416-424vestnovsu-345Research ArticleФИЗИКА КОНДЕНСИРОВАННОГО СОСТОЯНИЯCONDENSED MATTER PHYSICSСравнение методов MP2 и DFT для расчета структуры и ИК-спектров на примере соединений магния с аминокислотамиComparison of MP2 and DFT methods for calculating structure and IR spectra using the example of magnesium compounds with amino acidshttps://orcid.org/0009-0009-1479-8571БеспаловД. В.BespalovD. V.

Беспалов Дмитрий Вячеславович – преподаватель.

Омск

Omsk

d.v.bespalov@rambler.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9995-5672ГоловановаО. А.GolovanovaO. A.

Голованова Ольга Александровна – доктор геолого-минералогических наук, профессор, заведующий кафедрой.

Омск

Omsk

golovanoa2000@mail.ruОмский государственный университет имени Ф.М. ДостоевскогоРоссияDostoevsky Omsk State UniversityRussian Federation20241303202503(137)416424Copyright © Беспалов Д.В., Голованова О.А., 20252025Беспалов Д.В., Голованова О.А.Bespalov D.V., Golovanova O.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestnovsu.elpub.ru/jour/article/view/345

Построены структурные модели соединений магния с валином и глицином методом Мёллера-Плессе второго порядка (MP2) и методом функционала плотности (DFT) (функционал B3LYP) в базисе 6-31G(d). Рассчитаны частоты нормальных колебаний в ИК-спектре моделей. Показано сравнение рассчитанных ИК-спектров друг с другом и со спектрами синтезированных соединений, сделаны выводы об их строении. Полученные данные по координации соединений магния с аминокислотами могут помочь установить строение их комплексов.

Structural models of magnesium compounds with valine and glycine have been constructed. MP2 and DFT (B3LYP functional) methods in the 6-31G(d) basis were used for the construction. The frequencies of normal oscillations in the IR spectrum of the models have been calculated. Comparison of the calculated IR spectra with each other and with the spectra of the synthesised compounds is shown. Conclusions about the structure of the compounds are drawn. The obtained data on coordination of magnesium compounds with amino acids can help to establish the structure of their complexes.

Метод функционала плотностиМёллер-Плессетеория возмущениймагнийаминокислотаИК-спектрсинтезDensity-functional methodMøller–PlessetPerturbation theoryMagnesiumAmino acidIR spectrumSynthesisРабота выполнена в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (тема №075-03-2023-«Фундаментальная теория кристаллизации ОМА и физико-химических методов исследования патогенного минералообразования в организме человека с целью профилактики, блокирования патогенов и создания биомиметических систем доставки лекарств»)ReferencesЮдина Н. В., Торшин И. Ю., Громова О. А., Егорова Е. Ю., Быков А. Т. Обеспеченность ионами калия и магния – фундаментальное условие для поддержания нормального артериального давления // Кардиология. 2016. 56 (10). 80-89. DOI: 10.18565/cardio.2016.10.80-89Yudina N. V., Torshin I. Y., Gromova O. A., Egorova E. Y., Bykov A. T. Availability of Potassium and Magnesium Ions Is a Fundamental Condition for Maintenance of Normal Arterial Pressure // Cardiology. 2016. 56 (10). 80-89. DOI: 10.18565/cardio.2016.10.80-89Левчук Л. В., Бородулина Т. В., Санникова Н. Е., Данилова И. Г. Клиническое значение содержания свободных аминокислот для роста и развития детей // Уральский медицинский журнал. 2017. 5 (149). 11-15.Levchuk L. V., Borodulina T. V., Sannikova N. E., Danilova I. G. The clinical importance of free amino acids content for children's physical growth and development // Urals Medical Journal. 2017. 5 (149). 11-15.Waheed E. J., Obaid S. M. H., Abbas M. Ali. Biological Activities of Amino Acid Derivatives and their Complexes a Review // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. 2019. 10 (2). 1624-1641.Waheed E. J., Obaid S. M. H., Abbas M. Ali. Biological Activities of Amino Acid Derivatives and their Complexes a Review // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. 2019. 10 (2). 1624-1641.Кадырова Р. Г., Кабиров Г. Ф., Муллахметов Р. Р. Биогенные препараты, содержащие магний. Способ получения глицината магния // Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н. Э. Баумана. 2017. 229 (1). 52-55.Kadyrova R. G., Kabirov G. F., Mullakhmetov R. R. Biogenic medication which contains magnesium. Method of obtaining magnesium glycinate // Academic notes of Kazan state academy of veterinary medicine named after N. Bauman. 2017. 229 (1). 52-55.Милаева Е. Р., Додохова М. А., Шпаковский Д. Б., Антоненко Т. А., Сафроненко А. В., Котиева И. М., Комарова Е. Ф., Ганцгорн Е. В., Алхусейн- Кулягинова М. С. Механизмы цитотоксического действия оловоорганических соединений // Биомедицина. 2021. 17 (2). 88-99. DOI: 10.33647/2074-5982-17-2-88-99Milaeva E. R., Dodokhova M. A., Shpakovsky D. B., Antonenko T. A., Safronenko A. V., Kotieva I. M., Komarova E. F., Ganzgorn E. V., Alkhusein- Kulyaginova M. S. Mechanisms of cytotoxic action of organo-tin compounds // Journal Biomed. 2021. 17 (2). 88-99. DOI: 10.33647/2074-5982-17-2-88-99Блинова А. А., Блинов А. В., Пирогов М. А., Огурков К. А., Маглакелидзе Д. Г., Яковенко А. А. Компьютерное квантово-химическое моделирование взаимодействия фосфата кальция с аминокислотами // Физико- химические аспекты изучения кластеров, наноструктур и наноматериалов. 2022. 14. 352-361. DOI: 10.26456/pcascnn/2022.14.352Blinova A. A., Blinov A. V., Pirogov M. A., Ogurkov K. A., Maglakelidze D. G., Yakovenko A. A. Computer quantum chemical modeling of the interaction of calcium phosphate with amino acids // Physical and chemical aspects of the study of custers, nanostructures and nanomaterials. 2022. 14. 352-361. DOI: 10.26456/pcascnn/2022.14.352Mamand D., Qadr H. Density Functional Theory and Computational Simulation of the Molecular Structure on Corrosion of Carbon Steel in Acidic Media of Some Amino Acids // Russion Journal of Physical Chemistry. 2022. 96. 2155-2165. DOI: 10.1134/S0036024422100193Mamand D., Qadr H. Density Functional Theory and Computational Simulation of the Molecular Structure on Corrosion of Carbon Steel in Acidic Media of Some Amino Acids // Russion Journal of Physical Chemistry. 2022. 96. 2155-2165. DOI: 10.1134/S0036024422100193Буглак А. А., Помогаев В. А., Кононов А. И. Расчет спектров поглощения комплексов серебра с тиолятами // Компьютерные исследования и моделирование. 2019. 11 (2). 275-286. DOI: 10.20537/2076-7633-2019-11-2-275-286Buglak A. A., Pomogaev V. A., Kononov A. I. Calculation of absorption spectra of silver-thiolate complexes // Computer Research and Modeling. 2019. 11 (2). 275-286. DOI: 10.20537/2076-7633-2019-11-2-275-286Беспалов Д. В., Голованова О. А. Синтез, расчет структуры и ИК-спектров методом DFT ряда соединений магния(II) с аминокислотами. // Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Химия. 2024. 17 (1). 74-84.Bespalov D. V., Golovanova O. A. Synthesis, structure and IR spectra calculation by DFT of a number of magnesium (II) compounds and amino acids. Journal of Siberian Federal University. Chemistry. 2024. 17 (1). 74-84.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.